电气工程及其自动化专业始于北京交通大学前身北京铁路管理传习所1912年设置的“高等电气工程甲班”，历经百年，为国家培养了大批专门人才。专业以“宽口径、厚基础、重实践、求创新”为培养理念，面向轨道交通与电力能源领域培养理论基础扎实、工程素养过硬、具有创新意识及国际化交流能力、适应社会与经济发展需要的高素质人才。电气工程及其自动化专业于2012年通过国家工程教育专业认证。

电气工程及其自动化专业特点是弱电与强电结合、硬件与软件结合、元件与系统结合、基础科学与工程技术结合。